18 Kasım 1992 tarihinde İZBAK A.Ş – İzmir Büyükşehir Belediyesi Bakım, Onarım Makine San. Ve Tic. A.Ş. adıyla kurulan; 1999 yılında ise bugünkü şirket ünvanına sahip olan İZDENİZ A.Ş. – İzmir Deniz İşletmeciliği Nakliye ve Turizm Ticaret A.Ş., 2000 yılında Türkiye Denizcilik İşletmelerine bağlı gemi ve iskelelerin özelleştirilmesi projesi kapsamında Özelleştirme Yüksek Kurulu’nun 04 Nisan 2000 tarih ve 2000/06 sayılı kararı ile İzmir Büyükşehir Belediyesine devredilen “İzmir Körfez Hattı Deniz Yolu ile Yolcu ve Araç Taşımacılığını” yapmaya başlamıştır.
8 Mart 2000 tarihinde Türkiye Denizcilik İşletmeleri A.Ş. den devralınan 104 personel, 8 yolcu gemisi ve 3 Araba Vapuru ile İzmir Körfez Hattında Deniz Yolu ile Yolcu ve Araç Taşımacılığına başlayan İZDENİZ A.Ş, bugün 420 personeli, 13 adet Yolcu Gemisi, 2 adet Yüksek Hızlı Yolcu Gemisi, 5 adet Arabalı Vapur,1 adet Nostaljik Yolcu Gemisi ve 1 adet Yüzer Tesis ile İzmir iç Körfez’de 8, Dış Körfez’de ise 4 olmak üzere toplam 12 adet iskele ile hizmet vermeye devam etmektedir.
2000 yılında sadece 4 hat ve günde 60 sefer ile başlanılan Körfez Taşımacılığı; İzmir Büyükşehir Belediyesi’nin Körfez’de toplu ulaşım imkânlarını artırma yolunda yaptığı yatırımlar sayesinde her gün 9 farklı güzergahta toplam 205 sefer ile devam etmektedir. Yaz sezonunda ise programlı seferlere ilave olarak Güzelbahçe / Urla / Mordoğan / Foça İskelelerine seferler düzenlenmektedir.
İzmir Büyükşehir Belediyesi’nin İzmir’i bir Dünya kenti yapma ve deniz turizmine ivme kazandırma hedefleri doğrultusunda 2022 yılında başlattığı uluslararası İzmir – Midilli seferleri İZDENİZ A.Ş. tarafından gerçekleştirilmektedir.